Население империи хорезмшаха (Хорезма) во времена нашествия Чингисхана (1219–1221 годы) подверглось массовому истреблению.

Монголы захватили территорию государства, и города, особенно Бухара, Самарканд, Мерв, Бинакет, Ходженд и Гургандж, превратились в руины.

Шах не решился дать генеральное сражение монголам, оставив свою армию разбросанной отдельными отрядами по городам и крепостям всего государства.

Если город не сдавался добром, монголы учиняли зверские расправы над жителями.

Выживших ремесленников, толмачей и купцов угоняли в рабство.

После взятия городов - их полностью разрушали.

Китайский паломник Чан Чунь писал, что ранее население Самарканда составляло около 400 тысяч человек, после разгрома города Чингисханом в живых осталось около 50 тысяч.

Историк Рашид-ад-дин писал, что монголы выгнали в степь сразу всех людей, отделили от них около 100 тысяч ремесленников и послали в восточные страны, а молодых женщин и детей угнали в полон.

В ходе войны государство Хорезмшахов было уничтожено, оно вошло в состав Монгольской империи.

Из-за уничтожения свинцового акведука древнего самаркандского водопровода, обеспечивавшего питьевой водой город и его округ, городская жизнь на прежней территории Самарканда уже не возобновилась.

Были убиты тысячи учёных, сожжены библиотеки, разрушены медресе и мечети.